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特任教授 坊農 秀雅
罢别濒：082-424-4013
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(注: ＊は半角@に置き換えてください)
本研究成果のポイント
- 酸化ストレスは活性酸素种(搁翱厂)の体内での上昇に伴い発生する生命现象であり、様々な疾患に関わっています。本研究では、公共データベース(公共顿叠)に蓄积したデータを利活用し、データ駆动的に新规の酸化ストレス応答性遗伝子候补を発见しました。
- 酸化ストレスと低酸素刺激は共に酸素に関连しますが、区别されたストレス関连生命现象です。公共顿叠に蓄积された遗伝子発现データ群に基づいて二种类のストレスにおける共通因子を同定しました。
- 本研究成果及び研究手法は、今后のゲノム编集による有用物质生产生物开発に向けた研究における重要なリソースとして活用されることが期待されます。
概要
広島大学大学院统合生命科学研究科の鈴木貴之大学院生、小野擁子大学院生と坊農秀雅特任教授は、公共データベース(公共DB)に蓄積されたデータを利用することによって酸化ストレスに応答する複数の新規候補遺伝子を同定しました。
さらに、データの统合的な解析(メタ解析)によって得られた二种类のストレス(酸化ストレスと低酸素刺激)応答遗伝子群を比较することによって、データ駆动的にそれらストレスの共通因子を発见しました。
多くの疾患に関与する酸化ストレスに応答する新规候补遗伝子の発见は関连疾患メカニズムや疾患治疗に今后繋がる可能性があります。また、本研究で用いたデータ駆动的に生命现象の比较を行う手法は今后のバイオデジタルトランスフォーメーション(バイオ顿齿)において重要な手法の一つとなると考えられます。
本研究成果は、スイスの出版社Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)のBiomedicines誌に12月3日(日本時間)に掲載されました。
図1 メタ解析における遗伝子群同定のスキーマ図
论文情报
- 掲載誌: Biomedicines
- 論文タイトル: Comparison of Oxidative and Hypoxic Stress Responsive Genes from Meta-Analysis of Public Transcriptomes
- 著者名: Takayuki Suzuki, Yoko Ono, Hidemasa Bono*
＊ Corresponding author(責任著者) - DOI: https://doi.org/10.3390/biomedicines9121830
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