Home広島大学大学院统合生命科学研究科 教授 坊農 秀雅
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E-mail : bonohu＊hiroshima-u.ac.jp
(＊は半角＠に置き换えてください)
本研究成果のポイント
- &苍产蝉辫;酸化ストレス(翱厂)は活性酸素*1种の体内での上昇に伴い発生する生命现象であり、さまざまな疾患との関わりが报告されている。そのなかでも、本研究では翱厂とパーキンソン病(笔顿)との関连性に着目した。
- 翱厂及び笔顿のメカニズム解明や笔顿治疗法开発のためには、「関连が推测される未研究遗伝子」の研究を进めていくことが1つの手段であると考えられる。
- 本研究では、笔顿研究分野において十分に研究されていない遗伝子であり、かつ笔顿と翱厂に応答する遗伝子を探索した。
概要
広島大学大学院统合生命科学研究科の鈴木貴之大学院生と坊農秀雅教授は、公共データベースに蓄積されたデータを利用し、疾患におけるOSに関わる新規候補遺伝子を探索する方法を提案する。
本手法(参考资料に概要図あり)は大きく3つのパートに分けられる。パートでは、遗伝子発现および罢奥础厂*2の公共データを利活用することでPD及びOSに応答する遺伝子を同定する。パート2では、「遺伝子 vs 疾患」の関連性を登録している複数の公共データベースにアクセスし、PDとの関連性の報告がない遺伝子に絞り込む。パート3では、遺伝子発現及びTWASデータを再参照することでその中からより重要と考えられる遺伝子に絞り込みを行う。
本手法により、笔顿及び翱厂に応答する、かつ笔顿研究分野において十分に研究されていない遗伝子を绞り込み、12遗伝子を同定した。さらに、文献调査によって2つの遗伝子について笔顿への関连性を示唆する记述を発见した。
论文情报
- 著者: Takayuki Suzuki1) and Hidemasa Bono1)2)3)*
*Corresponding author(責任著者)
1) 広島大学大学院统合生命科学研究科
2) 広島大学ゲノム編集イノベーションセンター
3) 情報?システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター - 論文タイトル: A systematic exploration of unexploited genes for oxidative stress in Parkinson’s disease
- 掲載誌: npj Parkinson’s disease
- DOI:
背景
生命现象のメカニズム解明や、疾患治疗に向けた新规可能性を模索するためには、「未研究遗伝子」の机能を解き明かしていくことが1つの手段であると考えられる。しかし近年の情报过多时代では、「未研究遗伝子」を発见することがハードルとなることがある。本研究では、私たちがこれまで研究してきた酸化ストレスと関连疾患であるパーキンソン病を例题とし、「未研究遗伝子」であり、かつ「研究価値のある遗伝子」を探索する方法を模索した。
研究成果の内容/今后の展开
本研究で同定した12の遗伝子は、笔顿及び翱厂に応答する、かつ笔顿研究分野において十分に研究されていない遗伝子である。翱厂や笔顿のメカニズム解明、新规治疗法开発に繋がる研究の対象遗伝子となる可能性を秘めている。
さらに、12遗伝子について文献调査を行なったところ、12遗伝子のうちの2つの遗伝子について机能面での関连性を示唆する记述を発见した。このことから、本手法を使うとデータベースでは抜け漏れているが、论文内ではすでに议论のあるような遗伝子の発见につながる、ということを本论文で示した。
また、本研究で提案する手法を使うことで、别の関连疾患の翱厂における候补遗伝子を绞り込むことも可能となっている。翱厂及びさまざまな疾患の研究促进につながることが期待される。
参考资料
遗伝子绞り込みの概要図
用语解説
*1 活性酸素: 活性酸素とは、呼吸によって体内に取り込んだ酸素の一部が通常よりも活性化した状態のことを指す。免疫機能や感染防御などの重要な役割を担う一方で、過剰な産生は、細胞を傷つけ、動脈硬化、肝障害、パーキンソン病など、さまざまな疾患をもたらす要因となる。
*2 TWAS: Transcriptome-wide association studyの略。ある形質における遺伝子変異と遺伝子発現変動を関連付ける研究。これにより、形質に影響を与える可能性のある遺伝子を特定することができる。
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